Dividido en disciplinas y fases, esta metodología de desarrollo tradicionalista se enfoca en desarrollar un producto de alta calidad, siguiendo un proceso claro y definido con anterioridad, documentando cada aspecto del mismo.

Las fases de PRODIGIA son:

- Formulación: Contiene los procesos para el inicio del proyecto presentando como salida su respectivo anteproyecto de grado. 

- Especificación: Se modelan las diferentes vistas del software, se adelanta parte de la programación, se van actualizando los requerimientos, se actualiza la documentación existente y al final se obtienen las especificaciones técnicas del software.

- Programación: Se construye lo modelado en las vistas del software y se actualizan los requisitos, y se obtiene el prototipo de software validado.

- Entrega: Se obtiene la versión final de la documentación y se realiza un único documento entregable, en este caso es la monografía.